Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCL11BQ9C0K0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms