Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP44Q9C0F1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP44Q9C0F1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms