Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA4CQ9C0C4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms