Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTNAP4Q9C0A0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms