Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ROPN1BQ9BZX4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ROPN1BQ9BZX4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms