Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM8Q9BZR9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM8Q9BZR9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms