Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMIM3Q9BZL3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms