Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUF2Q9BZD4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUF2Q9BZD4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUF2Q9BZD4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUF2Q9BZD4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms