Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CELF4Q9BZC1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CELF4Q9BZC1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms