Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNG6Q9BXT2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms