Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CARD11Q9BXL7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CARD11Q9BXL7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms