Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLVAPQ9BX97 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms