Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRIP1Q9BX63 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRIP1Q9BX63 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms