Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HERC2P3Q9BVR0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HERC2P3Q9BVR0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms