Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PTDSS2Q9BVG9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTDSS2Q9BVG9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms