Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms