Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC39A3Q9BRY0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC39A3Q9BRY0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms