Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00467Q9BRT7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00467Q9BRT7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00467Q9BRT7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00467Q9BRT7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00467Q9BRT7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00467Q9BRT7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00467Q9BRT7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00467Q9BRT7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00467Q9BRT7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00467Q9BRT7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00467Q9BRT7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00467Q9BRT7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms