Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD5Q99717 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD5Q99717 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD5Q99717 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD5Q99717 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD5Q99717 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMAD5Q99717 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMAD5Q99717 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD5Q99717 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms