Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL13Q99616 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms