Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT12Q99456 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT12Q99456 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms