Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMS19Q96T76 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMS19Q96T76 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms