Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CPXM1Q96SM3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPXM1Q96SM3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms