Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CR12Q96Q35 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALS2CR12Q96Q35 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms