Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPRD1AQ96P16 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPRD1AQ96P16 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPRD1AQ96P16 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPRD1AQ96P16 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms