Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
YTHDC1Q96MU7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
YTHDC1Q96MU7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms