Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSMCE3Q96MG7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSMCE3Q96MG7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NSMCE3Q96MG7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NSMCE3Q96MG7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NSMCE3Q96MG7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NSMCE3Q96MG7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NSMCE3Q96MG7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSMCE3Q96MG7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.6 ms