Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC114Q96M63 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms