Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF4Q96M43 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF4Q96M43 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF4Q96M43 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF4Q96M43 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF4Q96M43 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF4Q96M43 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF4Q96M43 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF4Q96M43 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF4Q96M43 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF4Q96M43 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms