Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CNBD2Q96M20 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CNBD2Q96M20 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms