Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EP400Q96L91 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EP400Q96L91 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms