Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SUSD3Q96L08 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD3Q96L08 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms