Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GJD4Q96KN9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJD4Q96KN9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJD4Q96KN9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms