Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ4

MSLNL, Mesothelin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNLQ96KJ4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSLNLQ96KJ4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSLNLQ96KJ4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSLNLQ96KJ4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MSLNLQ96KJ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSLNLQ96KJ4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSLNLQ96KJ4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MSLNLQ96KJ4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSLNLQ96KJ4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms