Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A4AQ96JQ5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A4AQ96JQ5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms