Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDK5RAP3Q96JB5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK5RAP3Q96JB5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms