Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MS4A3Q96HJ5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms