Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C18orf8Q96DM3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C18orf8Q96DM3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms