Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
OPTNQ96CV9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OPTNQ96CV9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms