Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMIGD2Q96BF3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMIGD2Q96BF3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms