Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2E3Q969T4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2E3Q969T4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2E3Q969T4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2E3Q969T4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2E3Q969T4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2E3Q969T4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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UBE2E3Q969T4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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UBE2E3Q969T4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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UBE2E3Q969T4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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UBE2E3Q969T4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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UBE2E3Q969T4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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UBE2E3Q969T4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2E3Q969T4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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