Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF34Q969K3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF34Q969K3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms