Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKD2Q969F2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms