Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF516Q92618 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF516Q92618 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms