Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM3CQ92520 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM3CQ92520 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms