Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SSC4DQ8WTU2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SSC4DQ8WTU2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
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