Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL22A1Q8NFW1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
COL22A1Q8NFW1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms