Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND90

PNMA1, Paraneoplastic antigen Ma1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA1Q8ND90 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PNMA1Q8ND90 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PNMA1Q8ND90 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms