Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RTL3Q8N8U3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RTL3Q8N8U3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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