Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CLDN19Q8N6F1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CLDN19Q8N6F1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CLDN19Q8N6F1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CLDN19Q8N6F1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CLDN19Q8N6F1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CLDN19Q8N6F1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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